安徽工程大学研究生院是学校相继建立的第二个硕士研究生招生单位，至今已有10余年历史，目前共有13个硕士学位授权领域，涵盖了工学、理学、管理学、经济学、教育学、法学、文学等领域，其中工学、理学占主导地位。硕士研究生发展已成为学校办学水平和科研实力的重要体现之一。
在硕士研究生招生和管理方面，研究生院坚持以质量为中心，按照“统一管理，分级负责”原则，将招生、培养、管理、服务四个环节有机结合起来，不断完善招生工作制度，从但是源头杜绝造假行为。学校高度重视研究生学位授权点的建设，加快了专业布局和科研能力建设，同时积极探索研究生培养新机制，实现大学和产业资源的双重融合。
为全面提高研究生教育和科研环境，研究生院积极组织教师参与校内外学术交流，并广泛开展学术研究活动，使得研究生受益于学术氛围的激发和学科发展的带动。同时，学校大力支持财政、院系、企事业单位的科技合作，为研究生提供更多的就业机会和实践交流机会。
在未来的发展中，安徽工程大学研究生院将进一步提高研究生教育质量，扩大研究生规模，优化研究生培养机制，充分利用学校学科优势和资源，不断增强学校的科研实力和国际影响力。
